Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efcc1Q9JJF6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms