Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cldn19Q9ET38 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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