Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne8Q9DC53 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne8Q9DC53 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne8Q9DC53 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne8Q9DC53 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne8Q9DC53 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne8Q9DC53 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms