Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm3404Q9D506 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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