Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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GCN1Q92616 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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GCN1Q92616 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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GCN1Q92616 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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GCN1Q92616 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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GCN1Q92616 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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GCN1Q92616 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
GCN1Q92616 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCN1Q92616 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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GCN1Q92616 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCN1Q92616 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCN1Q92616 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCN1Q92616 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCN1Q92616 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCN1Q92616 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GCN1Q92616 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCN1Q92616 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCN1Q92616 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCN1Q92616 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCN1Q92616 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCN1Q92616 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCN1Q92616 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCN1Q92616 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCN1Q92616 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCN1Q92616 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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