Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf6Q91YR7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms