Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms