Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolbQ8K409 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolbQ8K409 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolbQ8K409 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PolbQ8K409 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolbQ8K409 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PolbQ8K409 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolbQ8K409 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PolbQ8K409 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolbQ8K409 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolbQ8K409 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolbQ8K409 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolbQ8K409 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolbQ8K409 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolbQ8K409 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolbQ8K409 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PolbQ8K409 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PolbQ8K409 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolbQ8K409 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolbQ8K409 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolbQ8K409 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PolbQ8K409 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PolbQ8K409 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms