Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Fbxo18Q8K2I9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Fbxo18Q8K2I9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Fbxo18Q8K2I9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Fbxo18Q8K2I9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms