Protein–RNA interactions for Protein: Q8K039

Uncharacterized protein KIAA1143 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8K039 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8K039 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8K039 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8K039 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8K039 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8K039 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Q8K039 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Q8K039 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8K039 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8K039 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8K039 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8K039 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8K039 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8K039 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8K039 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Q8K039 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8K039 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8K039 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8K039 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8K039 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8K039 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8K039 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8K039 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8K039 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8K039 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8K039 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8K039 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8K039 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8K039 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8K039 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8K039 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms