Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms