Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C5C9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C5C9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C5C9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C5C9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C5C9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C5C9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms