Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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