Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rims3Q80U57 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rims3Q80U57 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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