Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms