Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rad54bQ6PFE3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rad54bQ6PFE3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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