Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scaf8Q6DID3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms