Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga3Q62470 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga3Q62470 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms