Protein–RNA interactions for Protein: Q61382

Traf4, TNF receptor-associated factor 4, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf4Q61382 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Traf4Q61382 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Traf4Q61382 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Traf4Q61382 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Traf4Q61382 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Traf4Q61382 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Traf4Q61382 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Traf4Q61382 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Traf4Q61382 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Traf4Q61382 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Traf4Q61382 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf4Q61382 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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