Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgaeQ60677 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms