Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Gm29018-201ENSMUST00000188707 925 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms