Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms