Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms