Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox13Q04891 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox13Q04891 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox13Q04891 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox13Q04891 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sox13Q04891 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox13Q04891 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox13Q04891 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox13Q04891 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox13Q04891 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox13Q04891 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox13Q04891 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox13Q04891 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox13Q04891 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox13Q04891 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox13Q04891 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox13Q04891 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox13Q04891 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox13Q04891 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms