Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax5Q02650 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms