Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2aQ01320 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms