Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn1P70268 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms