Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga11P61622 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms