Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp5P56399 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms