Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rrp1P56183 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms