Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psen1P49769 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms