Protein–RNA interactions for Protein: P43028

Gdf6, Growth/differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf6P43028 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf6P43028 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms