Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnnd1P30999 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms