Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjc1P28229 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjc1P28229 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms