Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ggta1P23336 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ggta1P23336 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ggta1P23336 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ggta1P23336 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ggta1P23336 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ggta1P23336 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ggta1P23336 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ggta1P23336 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ggta1P23336 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms