Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms