Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms