Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlkO54988 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlkO54988 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SlkO54988 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SlkO54988 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SlkO54988 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SlkO54988 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SlkO54988 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlkO54988 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlkO54988 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlkO54988 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlkO54988 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlkO54988 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlkO54988 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlkO54988 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlkO54988 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlkO54988 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlkO54988 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlkO54988 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlkO54988 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlkO54988 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlkO54988 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlkO54988 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SlkO54988 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlkO54988 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms