Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3aO08665 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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