Protein–RNA interactions for Protein: L7N479

Tcrg-C3, T cell receptor gamma, constant 3, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-C3L7N479 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Tcrg-C3L7N479 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Tcrg-C3L7N479 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Tcrg-C3L7N479 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Tcrg-C3L7N479 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Tcrg-C3L7N479 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Tcrg-C3L7N479 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Tcrg-C3L7N479 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tcrg-C3L7N479 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Tcrg-C3L7N479 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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