Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm20939L7N243 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm20939L7N243 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20939L7N243 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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