Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm42421F6X8D5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms