Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms