Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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