Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms