Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubb1A2AQ07 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms