Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trav12-2A0N8N6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trav12-2A0N8N6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trav12-2A0N8N6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trav12-2A0N8N6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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