Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cog1Q9Z160 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms