Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NgfrQ9Z0W1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms