Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cldn3Q9Z0G9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cldn3Q9Z0G9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cldn3Q9Z0G9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cldn3Q9Z0G9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cldn3Q9Z0G9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cldn3Q9Z0G9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cldn3Q9Z0G9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cldn3Q9Z0G9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cldn3Q9Z0G9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cldn3Q9Z0G9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cldn3Q9Z0G9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cldn3Q9Z0G9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn3Q9Z0G9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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